In het plangebied zijn enkele waterpartijen aanwezig waarvoor in dit bestemmingsplan een specifieke regeling is opgenomen. De wateren die in de afbeelding aan zijn gegeven met een blauwe lijn, hebben ook een functioneel belang. Dit zijn de A-wateren binnen het watersysteem. Deze wateren zijn van belang voor een goede doorstroming. Dwars door de kern Doornspijk loopt de Klarenbeek. Deze is dan ook specifiek bestemd met de bestemming Water.
De dikke gele lijn met zwarte stippen is een primaire waterkering. Een primaire waterkering beschermd het binnendijks gebied tegen hoog (buiten)water als gevolg van hoge rivierwaterstanden.
Bij nieuwe ontwikkelingen is het van belang om een watertoets aan te vragen. Ook kan een zelfstandig wateradvies van de waterbeheerder nodig zijn. In Elburg is Waterschap Vallei en Veluwe de waterbeheerder. Het aanvragen van de watertoets en/of het wateradvies kan via de website